Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RxraP28700 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms