Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CtsgP28293 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CtsgP28293 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms