Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afxP27661 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afxP27661 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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