Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NdnP25233 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NdnP25233 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NdnP25233 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NdnP25233 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms