Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms