Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gja1P23242 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gja1P23242 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms