Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms