Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tap1P21958 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tap1P21958 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tap1P21958 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tap1P21958 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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