Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SftpcP21841 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms