Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc2P20801 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms