Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox5bP19536 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms