Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NefhP19246 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NefhP19246 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NefhP19246 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NefhP19246 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NefhP19246 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NefhP19246 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms