Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18528 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18528 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18528 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18528 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18528 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18528 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms