Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18524 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18524 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18524 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18524 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18524 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18524 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18524 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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