Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrgnP13609 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrgnP13609 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms