Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb1P12658 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms