Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa1P11477 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms