Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UbbP0CG49 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
UbbP0CG49 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms