Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb8P09632 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms