Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxb7P09024 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb7P09024 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms