Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MybP06876 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MybP06876 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MybP06876 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MybP06876 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MybP06876 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MybP06876 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MybP06876 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MybP06876 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MybP06876 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MybP06876 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MybP06876 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms