Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnfP06804 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnfP06804 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TnfP06804 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TnfP06804 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TnfP06804 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms