Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb1P04202 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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