Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp1O89090 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sp1O89090 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp1O89090 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sp1O89090 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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