Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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