Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tulp3O88413 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tulp3O88413 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms