Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms