Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb3O54890 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms