Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nek2O35942 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nek2O35942 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nek2O35942 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms