Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms