Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ebi3O35228 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ebi3O35228 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms