Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Degs1O09005 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Degs1O09005 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Degs1O09005 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Degs1O09005 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Degs1O09005 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Degs1O09005 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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