Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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