Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3453K7N724 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms