Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Casp8-203ENSMUST00000190213 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Gm21887J3QQ04 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Rab6a-203ENSMUST00000107048 2617 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm21887J3QQ04 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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