Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms