Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms