Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna9G3X8Z7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms