Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms