Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm5218F6YH22 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms