Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6F6VAN0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms