Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm10477F6SW83 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm10477F6SW83 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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