Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1979E9QAN3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm1979E9QAN3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm1979E9QAN3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm1979E9QAN3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm1979E9QAN3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm1979E9QAN3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1979E9QAN3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms