Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf169E9Q7F2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf169E9Q7F2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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