Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap11-1E9Q2E9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms