Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cfap46E9Q2C0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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