Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms