Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc6D3YZP9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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