Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Samd1D3YXK1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Samd1D3YXK1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Samd1D3YXK1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Samd1D3YXK1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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