Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cspp1B2RX88 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms